Transmembran proteinləri hüceyrə nəqliyyatında, siqnallaşdırma və ünsiyyətdə vacib rol oynayır. Bu proteinlərin funksiyası və dinamikası plazma membranının hər iki tərəfindəki qarşılıqlı təsirlər ilə dəqiq tənzimlənir; beləliklə, bu interaktomların tərkibinin xəritə edilməsi molekulyar biologiyada əsas bir çətinlikdir. Yaxınlıq etiketləmə üsulları bu məqsəd üçün güclü vasitələrdir; lakin, ümumiyyətlə, membran-sürənməyən reaktiv növlərə əsaslanan mövcud yanaşmalar transmembran proteinlərinin ya hüceyrədən kənar, ya da hüceyrə içi bölgələrə diqqət yetirir. Burada, transmembran proteinlərinin həm hüceyrədən kənar, həm də hüceyrə içi tərəflərinin eyni anda yaxınlıq etiketlənməsini həyata keçirmək üçün singlet oksigenin membran permeabilitəsindən istifadə edirik. Biz transmembran PhoxID (tmPhoxID) adlanan bu üsulunu canlı siçan beynindəki bir neçə reseptora (GRID2, GABAAR və GRM1) tətbiq edirik və onların spesifik membran yaxınlıqdakı hüceyrə içi interaktomlarını uğurla müəyyən edirik. Xüsusilə, müəyyən edilmiş proteinlərin şəbəkə təhlili bu metodun paralel lifPurkinje hüceyrə sinapslarında əmələ gələn transsinapti nano sütunların yerli komponentlərini xarakterizə edə biləcəyini göstərir. Bundan əlavə, araşdırmamız sıçanlarda və insan beynində əvvəlcədən təsnif edilməmiş GABAAR- CAMKV qarşılıqlı əlaqəni ortaya qoyub. Bizim nəticələrimiz transmembran və transselli yaxınlıq etiketlənməsi konsepsiyasının sübutunu təmin edir və transmembran proteinlərinin interaktomlarını təhlil etmək üçün güclü bir platforma qurur.
Yazıçılar K-yə təşəkkür etmək istəyirlər. Uçida, Y. Yabuki və E. Kusaka kimyəvi sintezi və birləşmələrin xarakterizasiyasında dəstək üçün; H. Nakamura, M. Tsujikawa və K. Plasmid hazırlığı üçün Matsuba; K. Nishizawa və T. S. Kawamoto və N. Lipid oksidləşmə analizi üçün Sugimoto; və H. Nanobody- fotosensibilizator konjugatlarının erkən mərhələli qiymətləndirilməsi üçün Utsunomiya. Nanodurmaların hazırlanmasında öz töhfələri üçün Radu Aricescu və Michisuke Yuzakiyə də təşəkkür edirik. Bu əlyazmanın bir layihəsini redaktə etdiyinə görə Edanz-dən Laura Murray, doktoraya təşəkkür edirik.
Bu iş İH-yə 23H05405 xüsusi təbliğatlı tədqiqatlar üçün Elm Təşviqi Təşviqi üzrə Yaponiya Cəmiyyəti tərəfindən dəstəklənmişdir; T.T.-yə JST FOREST proqramı (JPMJFR230G); JSPS Fellows üçün Elm Təşviqi üzrə Təşviqi Təşviqi üzrə Yaponiya Cəmiyyəti 21J23228 M.T.-yə; T.T.-yə T.Y.T.V. üçün T.Y.T.V.
Kimya Elmləri və Mühəndislik Departamenti, Kioto Universitetinin İncelektorluq Məktəbi, Kioto, Yaponiya
Fátima Yuri Tanimura Valor, Mikiko Takato, Ayane Araki, Seiji Sakamoto & Tomonori Tamura
Kioto Universitetinin İxtisaslı Enerji İnstitutu, Kioto, Yaponiya
Xülasə — davamını mənbədə oxuyun.
