Bu məqalə Science X-nin redaktorluq prosesi və siyasətlərinə uyğun olaraq nəzərdən keçirilib. Tərcüməçilər məzmunun etibarlılığını təmin edərkən aşağıdakı xüsusiyyətləri vurğulayıblar:
Konstruktor Universitetinin və Konstruktor Labs-in tədqiqatçıları BiteNetI-ni, 14 bioloji əhəmiyyətli ion növünün bağlanma yerlərini birbaşa üçölçülü protein strukturlarında yerləşdirən dərin öyrənmə modeli hazırlayıblar. Modeldə hər struktur üçün yalnız bir neçə saniyə lazımdır və Google DeepMind'in AlphaFold 3-ü də daxil olmaqla mövcud proqnozlaşdırıcılardan iki-üç dəfə daha yüksək dəqiqliyə çatır. İgor Kozlovski və Petr Popovun müəllifləri olan tədqiqat "Communications Biology" jurnalında dərc olunub. Bu vasitə dərmanların kəşf edilməsini və protein funksiyasının anlaşılmasını sürətləndirməyə kömək edə biləcək açıq bir platforma təmin edir.
Proteinlər insan hüceyrələrinin molekulyar iş atıdır, lakin nadir hallarda tək fəaliyyət göstərir. Onlar öz quruluşunu sabitləşdirmək, kimyəvi reaksiyaları başlatmaq və siqnalları ötürmək üçün ionlara və ya kalsium, natrium və kalium kimi kiçik yüklü qruplara güvənirlər. Bu ion qarşılıqlı əlaqələr səhv işlədikdə, ağır nevroloji, ürək-damar və ya metabolik pozuntulara səbəb ola bilər.
Atom qətnaməsi ilə ion bağlama yeri tam olaraq bilmək bir neçə səbəbdən dəyərlidir:
Lakin bu kimi yerlərin təcrübə yolu ilə müəyyən edilməsi yüksək qətnaməli röntgen kristalografiyasını və ya spektroskopiyanı tələb edir ki, bu da çox zəhmət çəkir və bahadır. Mövcud hesablama alternativləri adətən tək bir ion tipinə məhdudlaşır, strukturdan daha çox ardıcıllıqla işləyir və ya çox sayda proteinə miqyaslanmır.
Fizika əsaslı AI modeli BiteNetI bu problemə cavab verir. Müasir smartfon kameralarında aşkarlanan şəkil tanıma texnologiyasını molekulyar biologiyaya gətirir. Sistem bir proteini üçölçülü şəbəkəyə çevirir və 11 fərqli atom növündə bir animasiya video kimi mürəkkəb 3D formasını tarayır. Modeldən öyrənilən model, 12 mindən çox protein kompleksinin kurasiyalı rəqəmsal kitabxanasını öyrənərək 35 mindən çox dəqiq xəritəyə alınmış bağlanmış ionları ehtiva edir.
Xülasə — davamını mənbədə oxuyun.
