2. daha dәqiqi patahistologiya'dır. meyitdәn vә ya canlı orqan toxumasından götürülmüş materialdakı mikroskopik dәyişiklәrә әsasәn diaqnoz qoymağa imkan verir. mәsәlәn normalda qaraciyәr toxumasında *mallori cisimciyi * olmamalıdır. varsa, bәlli olur ki, adam babat içәndi, ya da haçansa içәn olub. ya da mәsәlәn, qalxanabәnzәr (tiroid) vәzidәn götürülәn materialda normalda olmayan *hurthle * hüceyrәsi tapılsa, diaqnoz qoyarıq ki, bu *haşimoto * xәstәliyidir.

(bax: biopsiya )