5. Azərbaycan Respublikasının ilk vitse-spikeri. 1994-cü ildə Heydər Əliyev tərəfindən Bişkekə göndərilmişdi. imzalanacaq atəşkəsin şərtləri ilə tanış olan Afiyəddin axşamkən telefon vasitəsi ilə öz etirazını Heydər Ə. bildirir, qarşılığında isə təcili şəkildə Bakıya dönməsi əmrini alır.
O, 1994-cü il sentyabrın 29-da Bakıda yaşadığı binanın blokunda sui-qəsd nəticəsində qətlə yetirilir. Ölümü barəsində müxtəlif versiyalar irəli sürülür. Belə ki, Türkiyənin Azərbaycandakı səfirliyinin keçmiş mətbuat müşaviri Turqut Ərin fikrincə, Afiyəddin Cəlilovun ölümünün əsas səbəbi Azərbaycanın altı rayonunun ermənilərə verilməsinin sirrini bilməsi idi. Onun qətlinin günahı XTPD zabitləri Mahir Cavadov və Rövşən Cavadovun üstünə atılır, lakin heç bir dəlil olmadığı üçün cinayət işi açılmır.
Hadisənin üstündən 26 il keçsə də, bu günə qədər qətlin sifarişçi və iştirakçıları barədə müəmmalar qalmaqdadır.