İnteqrativ yüksək hüceyrə genetik analizi Altsheymer xəstəliyində immunitet hüceyrələri üçün spesifik genləri və dərman repurposing hipotezlerini prioritetləşdirir

İmmun pozuntuları Alzheimer xəstəliyinə (AD) kritik töhfə verən bir faktor kimi daha çox tanınır, lakin genetik həssaslığın əsasında olan xüsusi immun hüceyrə kontekstləri və tənzimləyici genlər tam başa düşülməmişdir. Burada biz OneK1K mənbədən immun hüceyrə xüsusiyyətləri cis-əlamət miqdarı xüsusiyyət loci (cis-eQTL) iki nümunə Mendelian randomization (MR), Bayesian colocalization və müstəqil DICE replikasiyası istifadə edərək AD genom geniş assosiasiya tədqiqat məlumatları ilə inteqrasiya. Tədqiqat peripheral qan tək hüceyrəli RNA sekvensiyası (scRNA-seq) prioritetli genlərin hüceyrə tipli ifadə modellərini xarakterizə etmək üçün daha da tətbiq edildi. Biz naif/ mərkəzi yaddaş T hüceyrə alt dəstlərini və monocitlərlə əlaqəli populyasiyanı AD ilə əlaqəli genetik tənzimləyici siqnallar üçün zənginləşdirilmiş əsas immun kontekstləri kimi müəyyən etdik və KANSL1-AS1, CTSH, FCER1G, EPHA1-AS1, CRHR1 və JAZF1 də daxil olmaqla bir neçə immun hüceyrə xüsusi namizəd genlərinə prioritet verdik. Müstəqil məlumat dəstləri bir çox prioritetli siqnalların təkrarlana bilməsini dəstəkləyir. Dərman imzalanması resursları, qanbeyin bariyerinin (BBB) nüfuzluğun proqnozlaşdırılması, molekulyar bağlanma və fenomen üzrə əlaqələr analizi ilə inteqrasiya potensial genetik təhlükəsizlik narahatlıqlarını qiymətləndirərkən kəşfiyyat birləşməgen repurposing fərziyyələrini yaratdı. Birlikdə, bu tədqiqat İMS həssaslığını şərh etmək üçün immun hüceyrələrlə həll edilmiş genetik bir çərçivə təmin edir və daha da təcrübə təsdiqlənməsini tələb edən namizəd hədəfləri və müalicə hipotezlərini müəyyən edir.

Bu tədqiqat elmi-texnologiya innovasiyaları 2030-cu il üçün əsas layihələr (2022ZD0211600), Çin Milli Elm Fondunun (82271574, 82202137, və 81871069) və Jiangsu vilayətinin Səhiyyə Komissiyasının (ZDB2020008) əsas layihələri tərəfindən dəstəklənmişdir. Bu tədqiqat üçün vacib olan GWAS-ın ümumiləşdirmə statistikası və scRNA-seq məlumat dəstlərini səxavətlə təqdim edən bütün tədqiqatçılara minnətdarlığımızı bildiririk.

Bu müəlliflər bərabər şəkildə töhfə verirdilər: Yifu Sun, Zhe Zhong.

Neyrologiya şöbəsi, Şərqi Cənubi Şərq Universitetinin Jiangsu Baş Beyin Elmləri və Tibb Laboratoriyası, Nanjing, Çin Tibb Məktəbi, ZhongDa Xəstəxanasının üzvü

Yifu Sun, Zhe Zhong, Wu Zhou & Chunming Xie

Xuzhou Tibb Universitetinin Neyrologiya Departamentinin Xuaian, Çin ştatının Xuaian ştatının bağlı xəstəxanası