Bu məqalə Science X-in redaksiya prosesinə və siyasətlərinə uyğun olaraq nəzərdən keçirilmişdir. Redaktorlar məzmunun etibarlılığını təmin edərkən aşağıdakı atributları vurğuladılar: Bu yaxınlarda Nature Communications-da dərc olunan araşdırmada Berlin, Potsdam və Jenadan olan tədqiqatçılar epigenomun təhlili üçün yeni üsul təqdim etdilər. Maşın öyrənmə metodu nümunə etiketləri olmayan diferensial metilləşdirilmiş DNT bölgələrini müəyyən edir - bir çox mövcud alqoritmlər üçün ilkin şərt.
Bu, əvvəllər gizli olan bioloji nümunələri, eləcə də yeni hüceyrələrin və ya xəstəliklərin alt qruplarını müəyyən etməyə imkan verir. Genlərimizin fəaliyyəti təkcə DNT ardıcıllığı ilə müəyyən edilmir. Metil qrupları kimi tanınan kiçik kimyəvi birləşmələrin bağlanması hansı genlərin aktiv, hansıların isə susdurulmasına təsir edir.
Beləliklə, DNT metilasiyası epigenomun mərkəzi komponentidir. Epigenomdakı dəyişikliklər bədənimizin inkişafında həlledici rol oynayır, qocalma prosesinə təsir göstərir və xərçəng kimi çoxsaylı xəstəliklərə aiddir. Bu cür dəyişiklikləri başa düşmək üçün tədqiqatçılar xüsusi olaraq diferensial metilləşdirilmiş DNT bölgələrini (DMR) axtarırlar.
Bununla belə, mövcud üsullar adətən araşdırılan nümunələrin sağlam və ya xəstə toxuma kimi tanınmış qruplara təyin edilməsini tələb edir. Mürəkkəb klinik məlumat dəstləri ilə, lakin bu məlumat çox vaxt məlum deyil. Metilene3 adlı yeni proqram vasitəsi ilə tədqiqatçılar bu məhdudiyyəti aradan qaldıran bir üsul hazırlayıblar.
Proqram həm əvvəlcədən təyin edilmiş qruplar (nəzarət olunan rejim), həm də etiketlənməmiş nümunələr (nəzarətsiz rejim) arasında DNT metilasiya nümunələrini müqayisə edə bilər. Sonuncu rejimdə proqram nümunələri "sağlam" və ya "xəstəlik" kimi qruplara əvvəlcədən təsnif edilmədən DMR-ləri axtarır. Proqram, nümunələri avtomatik olaraq qruplaşdıraraq, metilasiya siqnalları əsasında genomu avtonom şəkildə seqmentləşdirir. Bu təsnifat nümunələr arasında epigenetik oxşarlıqları və inkişaf əlaqələrini vizuallaşdırmağa imkan verir.
Beləliklə, əvvəllər məlum olmayan hüceyrə növləri və ya xəstəlik alt qrupları, həmçinin nümunələrin artıq məlum olan xəstəliklər və ya hüceyrə tiplərinə bənzədiyi və fərqləndiyi bölgələr müəyyən edilə bilər. Eyni zamanda, bioloji fərqlər izlənilə bilər, çünki hər bir oxşarlıq və fərq xüsusi metilasiya nümunələrinə aid edilə bilər. Tədqiqatçılar daha sonra üsulu müxtəlif bioloji verilənlər bazasında sınaqdan keçiriblər.
Xülasə — davamını mənbədə oxuyun.
