Məkanlı transkriptomika makak qortexində A-dan-I-ə RNA redaktəsi imzalarını laminar və hüceyrə növü spesifik olaraq açığar

ADAR vasitəsilə A-I RNA redaktəsi düzgün neyron funksiyası üçün vacibdir. Bununla birlikdə, beyin qoruğunda yerüstü imzalanması əsasən araşdırılmamışdır. Bunu həll etmək üçün SRDRE-ni inkişaf etdirdik, yerli transkriptomik məlumatlarda RNA redaktə edilməsi yerlərini müəyyənləşdirmək üçün analitik bir çərçivə. Böyük makako kortexindəki 142 məkanlı kortika bölgəsində 40 milyondan çox hüceyrəni təhlil edərək laminar və hüceyrə növü xüsusi RNA redaktə mənzərələrini aşkar etdik. Xüsusilə, neyronal RNA redaktə səviyyələri vizual və somatosensorial sistemlərdə kortikal hiyerarxiya ilə əlaqəli idi. Parvalbumin nevronları əksər bölgələrdə ən yüksək redaktə fəaliyyətini göstərirdi. Bundan əlavə, ion kanalları genlərində, xüsusilə də prefrontal korteksin həyəcanlandırıcı nöron alt növlərində primatlarla zənginləşən yerləri müəyyən etdik. Nəhayət, ilkin tədqiqat analizisində, macaqlarda depressiya kimi davranış göstərən dorsolateral prefrontal korteksin dərin qatlarında dəyişmiş RNA redaktəsini müşahidə etdik. Bu da daha ətraflı araşdırmalara əsas verən potensial bir əlaqə göstərir. Bu tapıntılar RNA redaktəsinin rolunu və kortika ixtisaslaşmasına, beyin təkamülünə və neuropsixiatriya xəstəliklərinə potensial töhfələrini vurğulayır.

Professor Cai Song-a dərk edici şərhlərinə görə minnətdarıq. Texniki dəstək göstərdiyi üçün Çin Milli GeneBankına minnətdarıq.

Layihə Çinin Milli Əsas Tədqiqat və İnkişaf Proqramı (2024YFC3505100), Çinin Milli Təbii Elmlər Fondunun (No. 32571341), Çin Milli Əsas T&T Proqramı (2022YEF0203200, 2022YFC3400400, 2021YFA0805100 və 2020YFE0205900), Milli Elm və Texnologiya İnnovasiya 2030 Böyük Proqramı (STI2030-2022ZD0211700, STI2030-2022ZD0205000 və STI2030-2021ZD0200100), Zhejiang Əyaləti Vanguard T&T Proqramı (2023C03SA103409), Hangzhou Öndürmə İnnovasiya Komanda Proqramı.

Bu müəlliflər eyni dərəcədə töhfə verirdilər: Çeng Çen, Cing Yaŋ.

Həyat Elmləri Kolleci, Çin Elmlər Akademiyası Universiteti, Pekin, Çin

Cheng Chen, Ziyu Wang, Yunqi Huang & Hou Yong